Gió Nam Hiểu Lòng Tôi kể về hai nhân vật chính của phim là Chu Cựu và Phó Vân Thâm. Họ cùng nhau tìm kiếm một loại thảo dược để nghiên cứu thuốc. Thế nhưng sau đó, thành quả của Phó Vân Thâm lại bị anh em cùng cha khác mẹ Phó Tây Châu cướp đoạt.